Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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