Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Robo3Q9Z2I4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Robo3Q9Z2I4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms