Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms