Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn8Q9Z260 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms