Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
D17h6s53eQ9Z1R4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms