Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi1Q9Z185 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms