Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Srd5a3Q9WUP4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms