Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TapbpQ9R233 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TapbpQ9R233 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TapbpQ9R233 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TapbpQ9R233 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TapbpQ9R233 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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