Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim3Q9R1R2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms