Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra1Q9R118 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms