Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed2Q9R0Q3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms