Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf4Q9QZS2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms