Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ercc4Q9QZD4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms