Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnnt3Q9QZ47 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnt3Q9QZ47 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms