Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Rdh11Q9QYF1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Rdh11Q9QYF1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Rdh11Q9QYF1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Rdh11Q9QYF1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms