Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms