Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms