Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms