Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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