Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA2

Qtrt1, Queuine tRNA-ribosyltransferase catalytic subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Qtrt1Q9JMA2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Qtrt1Q9JMA2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Qtrt1Q9JMA2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms