Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msrb1Q9JLC3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150 ms