Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms