Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alyref2Q9JJW6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms