Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Efcc1Q9JJF6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms