Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms