Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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Cldn19Q9ET38 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Cldn19Q9ET38 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Cldn19Q9ET38 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Cldn19Q9ET38 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms