Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms