Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms