Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParvbQ9ES46 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms