Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr61Q9ERF3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms