Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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