Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3a2Q9EQR4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms