Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rhox9Q9EQM5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms