Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms