Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Tspan4Q9DCK3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Tspan4Q9DCK3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Tspan4Q9DCK3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Tspan4Q9DCK3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tspan4Q9DCK3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tspan4Q9DCK3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tspan4Q9DCK3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tspan4Q9DCK3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tspan4Q9DCK3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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