Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne8Q9DC53 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms