Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms