Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap1s2Q9DB50 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms