Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sgf29Q9DA08 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms