Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd9Q9D9M4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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