Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc91Q9D8L5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms