Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Derl3Q9D8K3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Derl3Q9D8K3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Derl3Q9D8K3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Derl3Q9D8K3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Derl3Q9D8K3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Derl3Q9D8K3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Derl3Q9D8K3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Derl3Q9D8K3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Derl3Q9D8K3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Derl3Q9D8K3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Derl3Q9D8K3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Derl3Q9D8K3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Derl3Q9D8K3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Derl3Q9D8K3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms