Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med11Q9D8C6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med11Q9D8C6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med11Q9D8C6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med11Q9D8C6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med11Q9D8C6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med11Q9D8C6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med11Q9D8C6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med11Q9D8C6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med11Q9D8C6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Med11Q9D8C6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med11Q9D8C6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Med11Q9D8C6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med11Q9D8C6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med11Q9D8C6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med11Q9D8C6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med11Q9D8C6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms