Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af1Q9D883 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms