Protein–RNA interactions for Protein: Q9D701

Upk3bl1, Uroplakin-3b-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bl1Q9D701 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bl1Q9D701 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms