Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms