Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam90a1bQ9D4F3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam90a1bQ9D4F3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms