Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sgms2Q9D4B1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms