Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms