Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D3J9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D3J9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D3J9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D3J9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D3J9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms